「ネットショップを始めたけど、売上がうまく伸びない」 「人手不足でネットショップの運営まで手が回らない」 近年、このような悩みを解決するために、ネットショップの運営代行を行っている企業が増えてきています。
しかし、いざ代行を頼もうと業者を探してみても、企業の紹介ページを見るだけではどの会社に依頼すればいいのか迷ってしまう方も多いのではないでしょうか。「安いから」、「おまかせプランだから」と安易な理由で決めてしまっては、自分が期待していたような結果を得られない可能性もあります。
自分にぴったりの企業を選ぶためには、代行業者に「どの業務に重点を入れて欲しいのか」を明確にした上で探すことが重要です。
特に注目度の高い15社については、表形式で料金や機能の違いが比較できる一覧表をご用意していますので、以下よりぜひダウンロードしてご活用ください。
なお、本記事では各ネットショップ運営代行の注目度を客観的に判断するために、「ネットショップ運営代行 比較」で検索し、検索上位10位までの紹介サイト9個を調査し、各サービスを登場回数順に並べました。ぜひ参考にしてください。
※スコアリングや掲載している企業情報などは2026年1月時点のものです。 
目次
- ＜比較表＞ネットショップ運営代行おすすめ15社
- 1.サヴァリ株式会社
- 2.アートトレーディング株式会社
- 3.株式会社いつも
- 4.GMOメイクショップ株式会社
- 5.株式会社飛躍
- 6.株式会社Proteinum
- 7.株式会社idiom
- 8.株式会社ワンプルーフ
- 9.株式会社YUGETA ECコンサルティング
- 10.イーラ株式会社
- 11.株式会社ザーナス
- 12.株式会社スタイリスト
- 13.株式会社バーチャルイン
- 14.株式会社ネットショップスタジオ
- 15.株式会社ロジスティクスウェーブジャパン
- その他おすすめのネットショップ運営代行7選
- ネットショップ運営代行を選ぶ際に注目すべきポイント4個
- ネットショップ運営代行に関するよくあるご質問
- まとめ
＜比較表＞ネットショップ運営代行おすすめ15社
本記事で紹介している15社の違いがひと目でわかる一覧表をご用意しました。短時間でサービスの比較をしていただけます。
1.サヴァリ株式会社
- モール特化型
- 広告運用による短期的な成果創出に強み
- データに基づいた具体的な施策で成果を出すアプローチ
| 初期費用 | 要問い合わせ |
|---|---|
| 料金プラン | 個別見積もり |
| 無料トライアル | 要問い合わせ |
| 対応業務の範囲 | 戦略立案、広告運用、商品設定、販促企画など |
| 対応カート／モール | 楽天市場、Amazon、Qoo10、Yahoo!ショッピング |
| 支援の具体策 | 広告運用最適化、ROAS改善、クーポン施策 |
| 運用体制 | 要問い合わせ |
| 報告の頻度・内容 | 要問い合わせ |
| 導入企業 | 食品、化粧品、アパレルな ど |
| 導入社数 | 要問い合わせ |
2.アートトレーディング株式会社
ART TRADING | ECサイト運営代行・ECコンサルティング 東京池袋 ART TRADING
- D2C・Shopify特化型
- 物流まで含めた統合サービスが強み
- 15年以上、200社以上の支援実績
| 初期費用 | 100万円～（Shopify構築） |
|---|---|
| 料金プラン | ■基本料金 EC運営支援：月額30万円～ ECコンサルティング：要問い合わせ |
| 無料トライアル | 要問い合わせ |
| 対応業務の範囲 | サイト制作、運営、コンサル、物流など |
| 対応カート／モール | Shopify、MakeShop、楽天市場 |
| 支援の具体策 | 構築段階から競合調査・ペルソナ設定 |
| 運用体制 | 伴走型協業体制 |
| 報告の頻度・内容 | 要問い合わせ |
| 導入企業 | 神田胡蝶、Mueller Japan |
| 導入社数 | 200社以上 |
3.株式会社いつも
- 大企業向け総合パートナー
- 圧倒的な実績（14,000件以上）とサービス範囲
- EC事業に関わるあらゆる領域を網羅
| 初期費用 | 要問い合わせ |
|---|---|
| 料金プラン | 要問い合わせ |
| 無料トライアル | 要問い合わせ |
| 対応業務の範囲 | EC事業全領域（コンサル・制作・広告・物流・CSなど） |
| 対応カート／モール | Amazon、楽天市場、Yahoo!ショッピング、自社EC |
| 支援の具体策 | モール広告運用・SNSマーケティング |
| 運用体制 | 部門別専門組織 |
| 報告の頻度・内容 | 月1回ミーティング（60分） |
| 導入企業 | 吉野家など大手企業多数 |
| 導入社数 | 累計契約14,000件以上 |
4.GMOメイクショップ株式会社
- プラットフォーム連携型
- データ活用力（12,000店舗のビッグデータ）と低コスト物流が強み
- 成果報酬型オプションあり
| 初期費用 | 0円～（成果報酬型は審査あり） |
|---|---|
| 料金プラン | 成果報酬型または固定費。物流は初期・月額0円プランあり |
| 無料トライアル | 要問い合わせ |
| 対応業務の範囲 | 戦略、制作、広告、物流、CS、ささげ業務 |
| 対応カート／モール | MakeShop、楽天市場、Amazon など |
| 支援の具体策 | 12,000店舗データ活用による分析 |
| 運用体制 | 専門チームによるワンストップ体制 |
| 報告の頻度・内容 | 月次レポート＋定例MTG |
| 導入企業 | Canon、Panasonic など |
| 導入社数 | 導入12,000店舗以上 |
5.株式会社飛躍
株式会社飛躍 Shopify Plus パートナー – 株式会社飛躍 | Shopify Plus Partners
- D2C・越境EC特化型
- Shopifyでのグローバル展開に最適
- Shopify Plusパートナー
| 初期費用 | 要問い合わせ |
|---|---|
| 料金プラン | 要問い合わせ |
| 無料トライアル | 無料セミナーあり |
| 対応業務の範囲 | Shopify構築・カスタマイズ、越境EC支援、運営代行 |
| 対応カート／モール | Shopify Plus特化 |
| 支援の具体策 | 越境EC向け市場調査、現地マーケティング |
| 運用体制 | 要問い合わせ |
| 報告の頻度・内容 | 要問い合わせ |
| 導入企業 | MAISON de SABRÉ |
| 導入社数 | 構築実績100件以上 |
6.株式会社Proteinum
楽天 Amazon ヤフー ネットショップのECコンサルと運営運用代行サービスなら | 株式会社Proteinum プロテーナム
- モール特化型コンサル
- 元プラットフォーマー等の専門家集団
- 広告運用による劇的な成果実績
| 初期費用 | 要問い合わせ |
|---|---|
| 料金プラン | 要問い合わせ |
| 無料トライアル | 無料EC診断（月5社限定） |
| 対応業務の範囲 | 戦略、データ分析、集客、制作・運用、利益改善 |
| 対応カート／モール | 楽天市場、Yahoo!ショッピング、Amazon、au PAYマーケット など |
| 支援の具体策 | ROAS改善による売上向上 |
| 運用体制 | 専任担当者によるサポート |
| 報告の頻度・内容 | 要問い合わせ |
| 導入企業 | 大安、SONOKO、THANN など |
| 導入社数 | 要問い合わせ |
7.株式会社idiom
株式会社idiom | 成果報酬のECサイト/モールの構築・運用代行会社
- 成果報酬特化型
- 「赤字リスクゼロ」の完全成果報酬モデル
- 全てのモール・カート・CMSに対応
| 初期費用 | 成果報酬型5％～ |
|---|---|
| 料金プラン | 要問い合わせ |
| 無料トライアル | 無料カウンセリングあり |
| 対応業務の範囲 | EC運営全般（サイト構築・配送・コンサル） |
| 対応カート／モール | 全モール・ASP・CMS対応（ecforceパートナー） |
| 支援の具体策 | SEO・SNS広告運用 |
| 運用体制 | 要問い合わせ |
| 報告の頻度・内容 | 要問い合わせ |
| 導入企業 | 要問い合わせ |
| 導入社数 | 要問い合わせ |
8.株式会社ワンプルーフ
株式会社ワンプルーフ| ECソリューション・EC運営代行・ECコンサルティング
- 大企業向け総合パートナー
- 組織的な運用体制（専任ディレクター）と明確な報告が強み
- 国内外の著名な大手企業をクライアントに持つ（2070社）
| 初期費用 | 要問い合わせ |
|---|---|
| 料金プラン | 要問い合わせ |
| 無料トライアル | 要問い合わせ |
| 対応業務の範囲 | ECコンサル＋実務支援（CS・HR対応） |
| 対応カート／モール | 楽天市場、Yahoo!ショッピング、Amazon、au PAYマーケット、EC-CUBE |
| 支援の具体策 | 販促企画、広告運用、SEO |
| 運用体制 | 専任ディレクター＋専門チーム20名以上 |
| 報告の頻度・内容 | 月次レポート、施策検証、ロードマップ |
| 導入企業 | デロンギ、レッドブル など |
| 導入社数 | クライアント総数2,070社 |
9.株式会社YUGETA ECコンサルティング
料金設定は自由。楽天運営代行 ECコンサルティング。単月契約のできるECコンサル運用代行。楽天・amazon・Yahooショッピングに対応｜YUGETA ECコンサルティング
- 中小企業向け柔軟モデル
- 料金自由設定と専任担当制が魅力
- 初期費用・解約金ゼロ
| 初期費用 | 0円 |
|---|---|
| 料金プラン | クライアントが月額料金を自由に設定（平均30万円） |
| 無料トライアル | 2週間5万円お試しプラン |
| 対応業務の範囲 | コンサル、運営代行、LP制作、広告運用 |
| 対応カート／モール | 楽天市場、Yahoo!ショッピング、Amazon、自社EC |
| 支援の具体策 | モールSEO、セール対策、広告最適化 |
| 運用体制 | 専任担当者一貫対応 |
| 報告の頻度・内容 | 要問い合わせ |
| 導入企業 | 要問い合わせ |
| 導入社数 | 要問い合わせ |
10.イーラ株式会社
イーラ株式会社 | 楽天・YahooのネットショップSEO、ECモールのコンサルタントはお任せください
- モール特化型（楽天・Yahoo!）
- モール内SEOに重点
- Web制作などEC以外のデジタルサービスも提供
| 初期費用 | 要問い合わせ |
|---|---|
| 料金プラン | 要問い合わせ |
| 無料トライアル | 要問い合わせ |
| 対応業務の範囲 | SEO、運営代行、Web制作、システム開発 |
| 対応カート／モール | 楽天市場、Yahoo!ショッピング |
| 支援の具体策 | モールSEO、LP制作、SNS広告 |
| 運用体制 | 要問い合わせ |
| 報告の頻度・内容 | 要問い合わせ |
| 導入企業 | 要問い合わせ |
| 導入社数 | 要問い合わせ |
11.株式会社ザーナス
EC・ネットショップの運営代行・コンサルティングなら株式会社ザーナス
- バランス型オールラウンダー
- 透明な料金と質の高い人材（店長経験者・有資格者）が強み
- 高い契約更新率（91%）
| 初期費用 | 0円 |
|---|---|
| 料金プラン | ■基本料金 ライトプラン：月額79,200円～ スタンダードプラン：月額250,800円～ フルサポートプラン：月額437,800円～ |
| 無料トライアル | 1ヶ月お試し・無料診断あり |
| 対応業務の範囲 | 戦略コンサル＋実務代行、動画制作も可 |
| 対応カート／モール | 全モール・全カート対応 |
| 支援の具体策 | ROAS保証型広告運用、心理学マーケティング |
| 運用体制 | 店長経験者による専門チーム |
| 報告の頻度・内容 | 週次・月次レポート、月次MTG |
| 導入企業 | 要問い合わせ |
| 導入社数 | 830社以上（更新率91%） |
12.株式会社スタイリスト
- モール特化型プレミアム
- 最高レベルの人材で圧倒的な成果を追求
- 全て自社内完結の一気通貫体制
| 初期費用 | 要問い合わせ |
|---|---|
| 料金プラン | ■楽天市場 【楽天】月商500万以下のショップ様向けフルサポートプラン：月額40～50万円＋成果報酬 など ■Yahoo!ショッピング 【Yahoo!ショッピング】100万円以下のショップ様のサポート：月額10～20万円＋成果報酬 など |
| 無料トライアル | 要問い合わせ |
| 対応業務の範囲 | 広告、CS、制作、開発まで一貫対応 |
| 対応カート／モール | 楽天市場、Amazon、Yahoo!ショッピング |
| 支援の具体策 | 美容・食品ジャンル特化広告 |
| 運用体制 | 元大手コンサルによるチーム体制 |
| 報告の頻度・内容 | レポートライン一本化 |
| 導入企業 | ユーグレナ、チャップアップ など |
| 導入社数 | 150社以上（継続率95%） |
13.株式会社バーチャルイン
商品撮影・物撮り400円 モデル撮影1800円 無料お試し有り | バーチャルフォト
- クリエイティブ特化型
- ECサイトの「見た目」を強化したい企業向け
- 高品質なビジュアルを高いコストパフォーマンスで提供
| 初期費用 | サービスによる |
|---|---|
| 料金プラン | 従量課金・サブスク（撮影400円／カット～） |
| 無料トライアル | 1商品無料撮影トライアル |
| 対応業務の範囲 | 撮影、動画制作、デザイン特化 |
| 対応カート／モール | Amazon、楽天市場、Yahoo!ショッピング |
| 支援の具体策 | ビジュアル制作によるCVR改善 |
| 運用体制 | 要問い合わせ |
| 報告の頻度・内容 | 該当なし |
| 導入企業 | 要問い合わせ |
| 導入社数 | 要問い合わせ |
14.株式会社ネットショップスタジオ
- データ重視型オールラウンダー
- 毎月20ページ前後の詳細なレポートが大きな特徴
- 全てのモール・カートシステムに対応可能
| 初期費用 | 要問い合わせ |
|---|---|
| 料金プラン | 要問い合わせ |
| 無料トライアル | 要問い合わせ |
| 対応業務の範囲 | EC支援（コンサルティング／実行支援）、DX支援（コンサルティング／実行支援） |
| 対応カート／モール | 全システム対応（楽天市場、Yahoo!ショッピング、ZOZO、Shopifyなど） |
| 支援の具体策 | ビッグデータ分析、SNS戦略 |
| 運用体制 | 専任担当者によるモール折衝 |
| 報告の頻度・内容 | 月次詳細レポート（約20ページ） |
| 導入企業 | 要問い合わせ |
| 導入社数 | 500店舗以上 |
15.株式会社ロジスティクスウェーブジャパン
- 物流特化型
- 物理的な商品管理・発送業務のアウトソースに最適
- 初期費用0円から利用可能な物流サービス
| 初期費用 | 0円（スターターパック） |
|---|---|
| 料金プラン | 出荷ごとの従量課金（510円～／件） |
| 無料トライアル | 要問い合わせ |
| 対応業務の範囲 | 物流・フルフィルメント特化（入荷・検品・発送） |
| 対応カート／モール | EC-CUBE構築実績あり |
| 支援の具体策 | 該当なし（物流支援中心） |
| 運用体制 | 10年以上経験の物流チーム |
| 報告の頻度・内容 | WMSによる在庫・出荷可視化 |
| 導入企業 | 要問い合わせ |
| 導入社数 | 要問い合わせ |
その他おすすめのネットショップ運営代行7選
株式会社アプロ総研
NE株式会社
株式会社エレクアライズ
株式会社ピュアフラット
株式会社fleston
株式会社オタツー
株式会社これから
ネットショップ運営代行を選ぶ際に注目すべきポイント4個
運営代行と一言にいっても様々な業務を扱う会社がたくさん出てくるため、自分に合う会社を探すのは難しいと感じている方も多いのではないでしょうか。
企業選びで悩むケースで多いのは、自分が代行業者に何を求めているのかが曖昧であるため、どのポイントで比較すればいいのかわからないということです。
今回は企業選びのときに特に押さえておきたいポイント4個を紹介します。
自社型かモール型か
ネットショップの運営方法は、大きく分けて自社のオンラインショップで販売する「自社型」、楽天やYahooショッピングのようなサイトに出店する「モール型」の2つがあります。
自社型では集客をすべて自分で行わなければならないため、SEO対策やリスティング広告のような検索エンジン向けに対策を練る必要があります。
モール型は、集客自体はモールが行ってくれます。しかし、多くのショップに埋もれてしまう可能性もあるため、モール内での広告戦略を検討しなければなりません。
どちらのタイプの代行を依頼するかによって業務内容や重点を置くポイントが異なるため、まず初めに確認しておきたいポイントです。
参考：ECモールとは？メリット・デメリット、費用相場、出店までの流れを紹介
どの業務に力を入れて欲しいのか
ネットショップの運営代行を頼む上で、どの業務に特に重点をおいて成果をあげて欲しいのかは、最も明確にしておきたいポイントです。
・運営戦略立案
・WEBページ作成・更新
・メールマガジン作成・配信
・SEO対策・広告運用
・在庫管理・受注処理・顧客対応
・物流作業代行
etc・・・
ネットショップの業務は多岐に渡っており、企業によって強みとしている業務や扱っている内容は異なっています。また、サービス内容も業務全般を代行するパッケージプランや、WEB制作・更新作業・メルマガ配信といった一部のみを請け負うプランまで様々あります。
事前に委託範囲や重点を置きたいポイントをはっきりさせておけば、「思っていたのと違う・・・」ということも避けられます。また、担当者に具体的な内容について問い合わせすることもできますので、比較検討がしやすくなります。
企業選びを始める前に、重きをおくポイントははっきりさせておくことが大事です。
自社でノウハウを身につけたいか、完全にお任せしたいのか
ノウハウを身につけたいか完全お任せかによって、代行業者に任せる業務と自社で行う業務の量が変わってきます。
繁忙期の補てんや人員不足のために一時的に代行お願いする場合は、業務の負担をできるだけ減らすためにも完全お任せのほうが向いています。
売上が伸びない、自分もノウハウを身につけておきたいと考えている場合は、自社業務は多いがサポート体制がしっかりとしている企業や、あるいはセミナー開催やコラム記事掲載など積極的に運営ノウハウの支援を行っている企業が向いています。
運営代行を頼むデメリットは、「ネットショップ運営のノウハウが自社に残りにくい」という点です。ノウハウを身につけておくに越したことはありません。しかし、自社の負担も増えるため、現状を踏まえた上でどちらのタイプがいいのか確認しておくことが大切です。
ネットショップ運営のノウハウを知りたい人は、このような記事が参考になります。
【LISKUL】ECサイトの担当者が覚えておくべき売上アップの基本ポイント13個
【LISKUL】ありがちな失敗例から学ぶネットショップの開業を成功させるための教訓
JECCIC一般社団法人ジャパンEコマースコンサルタント協会
予算と費用体系
予算をいくらまで掛けられるかで委託できる業務内容の程度は変わってきます。
また、報酬をいくら支払うのかも企業によりけりですので、なかなか比較がしづらいと思います。
ここでは主体となっている費用体系の3パターンを紹介します。
(1)成果報酬型
売上の●%を報酬として支払う変動型の費用体系です。
売上総額から報酬を算出する場合は「売上総額型」、売上の成長分から報酬を算出する場合は「売上成果型」に分けられます。
メリット：売上が出なければ支払う必要がないので、失敗したときのリスクは少ない
デメリット：報酬率が高く、場合によっては固定報酬型よりも高額になる
(2)固定報酬型
売上や成果に関係なく、期間に応じて固定額を支払う費用体系です。
メリット：費用が明確なため、予算が立てやすい
デメリット：売上が伸びなかった場合でも固定額を報酬として支払わなければならない
(3)複合型
上記の成果報酬に加えて、固定報酬も支払う費用体系です。
メリット：報酬率・固定額は低めに設定されている
デメリット：固定額に加えて、売上に応じた報酬も支払う
初期費用に関しては無料で行っている企業もありますが、基本的には「初期費用＋上記の費用体系」の企業が多いです。
金額や報酬の歩合などは企業によって異なっていますので、費用体系と合わせて検討してください。
ネットショップ運営代行に関するよくあるご質問
ネットショップの運営代行を検討中の方に役立つQ＆Aをまとめています。
Q. ネットショップ運営代行の主なサービス内容は何ですか？
A.主に、受注管理、在庫管理、商品登録、SEO対策、広告運用、顧客対応などがあります。 各運営代行会社のサービスを比較したい場合は、以下の比較表をダウンロードして参考にしてください。
Q. ネットショップ運営代行の料金相場はどのくらいですか？
A.全体の相場は不明ですが、LISKULでリサーチしたサービスの中では、初期費用は無料〜110,000円、月額費用は30,000円〜300,000円程度が相場です。詳しくは提供元にお問い合わせください。
Q. ネットショップ運営代行の初期費用はかかりますか？
A.初期費用は無料のサービスもあれば、要問い合わせのサービスもあります。詳細は提供元にお問い合わせください。
Q. ネットショップ運営代行サービスはどのモールに対応していますか？
A.楽天市場、Yahoo!ショッピング、Amazonなどに対応しているサービスが多いです。詳細は提供元にお問い合わせください。
Q. ネットショップ運営代行の広告運用代行にはどんな内容がありますか？
A.検索エンジン広告、SNS広告、ディスプレイ広告などがあります。詳細は提供元にお問い合わせください。
まとめ
今回は厳選企業と企業選びのポイントを紹介いたしました。
自分に合った企業を選ぶためにも、代行業者を探し始める前に「どの業務に力を入れてほしいのか」を明確にしておけば、候補も絞りやすくなります。
企業選び際の参考になりましたら幸いです。
